如果是JAPAN RAIL PASS的乘車區間內，並且是設有自由席的新幹線（除了希望號、瑞穗號以外）或特急列車的話，可以不指定座位，選擇自由席車廂乘坐。而東海道·山陽·九州新幹線的希望號和瑞穗號不論是指定席（包含綠色車廂）還是自由席都不能乘坐。如果想要搭乘的話，請購買「【JAPAN RAIL PASS專用】希望號·瑞穗號使用券」。
此外，如果想要搭乘除了希望號和瑞穗號以外的列車的指定席，或是搭乘沒有自由席車廂的列車（所有座位都是指定席的列車），那麼需要提前領取指定席的車票。請務必提前前往JR車站內的指定席售票機、綠色窗口（售票處）、旅遊中心等，領取指定席券（不需要追加費用）。如果是在「JAPAN RAIL PASS Reservation」（以下稱為「JRPR」）購買了JAPAN RAIL PASS，那麼也可以在JRPR預約指定席位。
關於可乘車區間的詳情請參閱此處。
關於領取指定席券的詳情請參閱此處。
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